期刊简介
《中国全科医学》创刊于1998年,是经国家科委批准,由中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会主管,中国医院协会、中国全科医学杂志社主办的国内公开出版发行的全科医学学术性刊物。旬刊。国际标准连续出版物号:ISSN 1007-9572,国内统一连续出版物号:CN 13-1222/R;邮发代号:80-258。该杂志是以宣传党和国家有关医疗卫生改革的方针政策;研究中国全科医学/社区卫生服务发展的现状、特点和趋势;交流全科医学临床研究成果和全科医疗实践经验;普及全科医学理论知识,提高广大基层医务人员的“全科意识”,实现生物医学向生物-社会-心理医学模式转变为宗旨的学术平台。核心收录情况:1.2014年版(即第七版)《中文核心期刊要目总览》综合性医药卫生类核心期刊。2.2015年版中国科技核心期刊(中国科技论文统计源期刊),影响因子为1.057。3.2015年-2016年《中国科学引文数据库》(CSCD)来源期刊收录。国际数据库收录情况:美国《化学文摘》(CA);荷兰《医学文摘库/医学文摘》(EM);《俄罗斯文摘杂志》(AJ);波兰《哥白尼索引》(IC);EMCare数据库;EMBiology数据库(EMBiology);EMCare数据库(EMCare);世界卫生组织西太平洋地区医学索引(WPRIM);Ulrich。
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- 杂志名称:中国全科医学杂志
- 主管单位:中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会
- 主办单位:中国医院协会,中国全科医学杂志社
- 国际刊号:1007-9572
- 国内刊号:13-1222/R
- 出版周期:旬刊
期刊荣誉:获2000-2001年度河北省优秀期刊期刊收录:北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), CA 化学文摘(美), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 万方收录(中), 知网收录(中), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 国家图书馆馆藏, 上海图书馆馆藏
基于文献挖掘的前列腺癌蛋白组学与基因组学差异基因的生物信息学分析
陈晨;曹笑歌;张立国;么安亮;刘健;康绍叁;高伟兴;韩会;曹凤宏;李治国
关键词:前列腺肿瘤, 基因组学, 蛋白组学, 生物信息学
摘要:目的:通过前列腺癌(PCa)蛋白组学与基因组学文献,挖掘与 PCa 存在相关性并缺乏具体研究的差异基因,并分析其参与的生物过程与通路。方法计算机检索 PubMed 数据库,检索策略:“(prostate cancer[Title]) AND Proteomics”“(prostate cancer[Title])AND Genomics”,时间限定为建库至2015年1月。按照 PCa 与前列腺增生(BPH)组织(A 组)、PCa 与邻近良性组织(B 组)、PCa 高 Gleason 评分与低 Gleason 评分(C 组)蛋白谱和基因谱的比较提取差异蛋白或基因,输入“ The Protein Information Resource ( PIR,Georgetown University Medical Center, Washington,DC 20007,USA)”,按照“ official gene symbol”统一名称。采用“ DAVID Bioinformatics Resources 6.7(National Institute of Allergy and Infectious Diseases,NIH,USA)”在线工具对差异基因进行 GO( Gene Ontology)、KEGG 等生物信息学分析。结果共纳入35篇文献,提取差异基因764个,其中 A 组差异基因162个,B 组差异基因423个,C 组差异基因209个,3组共同差异基因21个。A 组差异基因中 DES 报道多,为6次;B 组差异基因 ACPP报道多,为4次;C 组差异基因 ACTN1、HSPB1、LMNA 报道多,均为3次。GO 分析结果显示,差异基因涉及的生物过程主要有细胞死亡调控、细胞增殖调控、创伤反应、蛋白质转运、稳态过程(差异基因频数≥72,频率≥9.4%),细胞成分主要涉及胞外区、膜封闭腔、细胞骨架、囊泡以及线粒体(差异基因频数≥85,频率≥11.1%),分子功能主要涉及核苷酸结合、钙离子结合、相同蛋白结合以及酶结合(差异基因频数≥60,频率≥7.9%)。KEGG通路分析发现,差异基因主要参与癌症通路、黏着斑、肌动蛋白细胞骨架调控、MAPK 信号等生物学通路(差异基因频数≥29,频率≥3.8%)。对各组差异基因进行 KEGG 通路分析结果显示,各组差异基因共同参与的 KEGG 通路主要有黏着斑、补体及凝血级联、ECM 受体相互作用等生物学通路。结论差异基因 DES、ACTN1、ATP5B、TLN1、COL6A2、MYH9、OGN、PGAM1报道次数较多,而其参与 PCa 发生发展的具体机制未见报道,值得进一步实验验证。黏着斑、肌动蛋白细胞骨架的调控以及 MAPK 信号通路可能在 PCa 发生发展过程中发挥重要作用,对其进一步分析将为临床治疗 PCa 提供新的靶点。
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